崇祯十二年正月二十九日申时，崇文门官军执驸马巩永固献门，薛家军涌入崇文门，随后宣武门、正阳门相续被打开，薛破虏率大军从正阳门进入北京内城，襄诚伯李国祯被降军献与薛破虏，薛破虏执手安慰李国祯，希望李国祯继续统领京营，被李国祯拒绝，薛破虏没有勉强，派兵送李国祯回府与家人团聚。
彭郎君率领的特种部队包围了皇宫，薛破虏让太监曹化淳去劝慰崇祯皇帝，曹化淳战战兢兢的进了紫禁城，不过薛破虏并没有打算进入皇宫，再调了五千士兵协助彭郎君围困，皇宫里的一切等少爷进京再行处理。
随后薛破虏在骆养性的陪同下，去了锦衣卫诏狱，亲自接宣、大、山西总督卢象升出狱，希望卢象升能够为薛家军效力，哪知道卢象升根本不买薛破虏的帐，骆养性上前好言相劝，却被卢象升斥为奸邪败类，骆养性含羞而退，薛破虏只好劝慰了卢象升几句，见卢象升对自己不理不睬，只好先离开了锦衣卫诏狱。
接着薛破虏马不停蹄赶往西四牌楼宝禅寺兵部尚书喻安性的寓所，可是喻安性也没有给薛破虏，硬是让薛破虏在大门外站到深夜，薛破虏干脆裹着一件皮袍，站在俞府大门对面的房屋的木柱下，一直等到第二天天亮。
心情矛盾的喻安性一夜没睡，知道崇祯皇帝已经大势已去，可是自己立刻就为薛家军做事，害怕被同僚斥为卖主求荣，可是薛破虏的诚意让喻安性非常感动，自己内心很大程是赞同薛家军一些做法的，自己思量五千，又被妻儿家人苦劝，喻安性只好开门接薛破虏进府，薛破虏乃尊喻安性为上司，行跪拜礼觐见喻安性。
随后喻安性接受了薛破虏的邀请，以薛家军首位阁臣的身份，出面负责大明内阁事务，除首辅刘宇亮在天津卫，杨嗣昌、范复粹称病不出，傅冠、薛国观、程国祥、方逢年、蔡国用俱到内阁办公，大明行政开始正常运转。
曹化淳是二月初一日已时见到薛破虏的，曹化淳告诉薛破虏，崇祯皇帝和三个皇子不见了，天启皇帝的张皇后自尽被宫女救了下来，薛破虏吓出了一身冷汗，下令曹化淳回宫继续寻找崇祯皇帝和三个皇子，并确保皇宫的皇后皇妃不得出事，曹化淳带着愁苦的脸回紫禁城去了。
薛破虏立刻命令关闭北京城，特别是北京城内城更是进行了地毯式搜查，三个皇子子太子慈烺、三子定王慈炯、四子永王慈焕很快外戚勋臣送来了，薛破虏把三个皇子送回皇宫他们母亲身边，可是崇祯皇帝还是无影无踪。
崇祯十二年二月初八日，薛云率领十万大军到达北京城外，在京城官员百姓的夹道欢迎声中，由薛破虏、薛五率领的薛家军为前导，薛云领一万精锐将士入城，大军从沿紫禁城皇宫而过，出正阳门转至崇文门东大街，薛云率女眷入住长期空置的总兵府。
薛云得知崇祯皇帝还是在煤山的老槐树下自缢了，最终没有逃脱人生的宿命，自己也避免了如何处理崇祯皇帝的尴尬局面，让薛云感到欣慰的是，崇祯皇帝没有对自己的后妃子女痛下杀手，大臣中礼部尚书兼东阁大学生杨